Река протекает в восточной части Верхне-Тазовского природного заповедника, который расположен в Красноселькупском районе Ямало-Ненецкого автономного округа. Название произошло от видоизмененного старого языка кетских племен «елок» - Елогуй.

Истоки - Правый и Левый Елогуй на заболоченном Обь-Енисейском водоразделе Западно-Сибирской низменности. Медленно течёт среди лесов Красноярского края и Ямало-Ненецкого автономного округа. Устье - речка Енисей. Впадая в Енисей несколькими мелководными рукавами, образует значительную низменную дельту. В XVIII веке служила водным путём из бассейна Оби в Енисей.

Елогуй - таежная река с довольно глубокими ямами протяженностью в 464 километра, шириной от 30 до 100 метров. Берега верхнего и среднего течения возвышенные, покрытые дремучими сосновыми лесами, в низовьях - низменные и болотистые. Главные притоки Елогуя: реки Кокса, Кола и Безымянка. Елогуй используется для рыбалки. В ней обитают довольно крупные экземпляры тайменя (более 25 кг), щуки (до 20 кг) и окуня (до 4 кг).